CIP(就地清洗)漂清用水

微生物安全性对用作最后CIP漂洗用水及消毒方案都是至关重要的。全自动紫外线消毒系统能够结合CIP漂清周期使用，确保最终的漂清用水不会再次引入微生物污染。由于中压紫外灯管自身的机械强度高，它们不会受到CIP水温突变的影响。

过滤消毒

反渗透(RO)和颗粒状活性碳(GAC)过滤法常被用来过滤生产用水，但是也可能成为细菌的滋生地。紫外线能够有效地消毒RO和GAC的产水，而且已在加工产业中使用多年。

脱氯

GAC过滤器常被用来脱去生产用水中的氯气，除去由于氯水消毒“挥发出”的气味，从而保证最终产品的味道不走样、没有任何多余的味道或气味。将紫外线消毒系统安装在GAC过滤器前，能够改善GAC过滤器的性能，延长活性碳的使用寿命，从而降低运营成本。

糖浆

糖浆可能是微生物最理想的滋生场所。尽管糖份含量很高的糖浆并不利于微生物的生长，但是休眠的孢子会在糖浆被稀释后恢复活性。在加工糖浆和稀释时进行紫外线消毒能够确保休眠的孢子完全失去活性。

罐顶空间的消毒

消毒系统也可用于压力罐或管装易腐液体内填充空气的消毒。贮藏罐极易受空气中散布的孢子的影响。为了防止污染的产生，潜水式紫外线处理系统应运而生，专用于罐顶部空间空气的消毒。

废水

饮料生产排放的废水能够在不使用有害环境化学物质的前提下得到有效处理。这就能确保所有排放的废水能满足各地不同的环境法规。正如上文所述，生产用水可以在经过紫外线消毒处理后再利用，大大降低了废水量。